Cuando otro Mega Tiburón regresa de las profundidades del mar, los ejércitos mundiales entran en alerta máxima. El tráfico marítimo se paraliza mientras todos viven con miedo a la bestia insaciable. Sin opciones, el gobierno de Estados Unidos desata el proyecto ultrasecreto Mecha Tiburón: un tiburón mecánico diseñado para tener las mismas características que Mega. Un par de científicos pilotean la criatura mecánica mientras luchan contra Mega en una batalla campal para salvar el planeta. Pero cuando una mecánica defectuosa hace que el Mecha ataque a los humanos, los científicos deben guiar a Mega hasta Mecha con la esperanza de que los dos titanes se maten entre sí o se arriesguen a una destrucción mundial incalculable.